Hoạt động nghiên cứu khoa học của Trường Đại học Sư phạm Thành phố Hồ Chí Minh tập trung vào các nhiệm vụ trọng tâm sau đây:

• Nghiên cứu khoa học cơ bản trên các lĩnh vực tự nhiên – công nghệ và xã hội – nhân văn.
• Nghiên cứu khoa học giáo dục nhằm đáp ứng yêu cầu phát triển của ngành, nâng cao chất lượng quản lí, đào tạo, đổi mới phương pháp dạy học.
• Hợp tác nghiên cứu khoa học với các địa phương, các tổ chức kinh tế – xã hội, ứng dụng và chuyển giao sản phẩm công nghệ ...

1. Trường tiếp đón Ngài Chris Carter, Bộ trưởng Bộ Giáo dục New Zealand đến thăm và làm việc (năm 2008). 2. Ngài Ikuo MIZUKI, Tổng Lãnh sự Nhật Bản tại TP.HCM và TS. Bạch Văn Hợp, Bí thư Đảng ủy, Hiệu trưởng tại Lễ kí kết viện trợ (năm 2008). 3. Khoa Tiếng Anh kí kết hợp tác với Trường Đại học Cambridge (năm 2007)	4. Trường kí kết thỏa thuận hợp tác với Trường Đại học Wakayama, Nhật Bản (năm 2007). 5. Lãnh sự Cộng hòa Liên bang Nga tại TP. Hồ Chí Minh và lãnh đạo Trường cắt băng khánh thành Trung tâm Nga tại Trường (năm 2010). 6. TS. Bạch Văn Hợp, Hiệu trưởng (bìa phải) và đại diện công ty AEON (Nhật Bản) kí kết thỏa thuận tài trợ học bổng cho sinh viên (năm 2011).

Từ năm 1998 đến nay, toàn Trường có 174 đề tài khoa học cấp Bộ, 50 đề tài cấp Thành phố và 290 đề tài khoa học cấp Cơ sở. Đặc biệt, năm 2004, Trường đã đạt giải xuất sắc nhất cuộc thi SAMSUNG DigitAll HOPE 2004 với sản phẩm “Từ điển kí hiệu giao tiếp của người khiếm thính”. Tại cuộc thi APICTA 2005 được tổ chức ở Chiangmai, Thái Lan (2/2006), Trường Đại học Sư phạm Thành phố Hồ Chí Minh là đơn vị duy nhất đại diện cho Việt Nam đã đoạt Cúp Vàng - giải thưởng về Công nghệ thông tin - Truyền thông Châu Á - Thái Bình Dương với sản phẩm nói trên.

Từ năm 2001 đến nay, Trường đã tổ chức 111 hội thảo khoa học các cấp, góp phần khẳng định vai trò, uy tín của Trường trong và ngoài nước.

Tiêu biểu là: Hội thảo Lí thuyết tối ưu và ứng dụng, Hội thảo Công nghệ đào tạo trong đào tạo và bồi dưỡng giáo viên, Hội thảo Tự chủ tài chính trong các trường đại học, Hội thảo Hội đồng Trường trong các trường đại học, Hội thảo Nghiên cứu khoa học của sinh viên các trường Sư phạm, Hội thảo Các giải pháp cơ bản nâng cao chất lượng Giáo dục Đại học, Hội thảo Cuộc kháng chiến chống Mỹ cứu nước (1954-1975) và 30 năm xây dựng và bảo vệ Tổ quốc (1975-2005), Hội thảo Nâng cao hiệu quả nghiên cứu khoa học và đào tạo Sau Đại học tại Trường Đại học Sư phạm Thành phố Hồ Chí Minh.